49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1645 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  717    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  35.76 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  35.76 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  33.96 
 
 		 356 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  34.71 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  35.96 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  34.09 
 
 		 366 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  28.19 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  27.66 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  27.66 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  29.17 
 
 		 344 aa  99  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  29.95 
 
 		 433 aa  92.8  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  39.06 
 
 		 307 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  33.51 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  32.67 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  32.67 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  28.21 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  23.53 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  23.53 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  23.75 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  23.75 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  29.45 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  45.61 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  45.61 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  23.47 
 
 		 628 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  25.39 
 
 		 425 aa  52.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  24.88 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  27.89 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  45.1 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  24.81 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  23.67 
 
 		 849 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  23.67 
 
 		 849 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  24.81 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  24.81 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  34.78 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  35.85 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  27.67 
 
 		 183 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  25.14 
 
 		 694 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  27.12 
 
 		 569 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  27.81 
 
 		 638 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  27.81 
 
 		 638 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  27.81 
 
 		 638 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  27.81 
 
 		 638 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  23.12 
 
 		 568 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  27.1 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3577  TniQ family protein  23.84 
 
 		 407 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0706835  hitchhiker  0.00685617 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  26 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1175  transposition protein TniQ  26.01 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  25.63 
 
 		 636 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>