18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3194 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1251    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  93.08 
 
 
636 aa  1124    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  46.94 
 
 
610 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  35.76 
 
 
701 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  48.21 
 
 
355 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  30.17 
 
 
617 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  31.03 
 
 
618 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  28.46 
 
 
609 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  26.51 
 
 
612 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  25.67 
 
 
613 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  25.8 
 
 
632 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  26 
 
 
610 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  44.23 
 
 
689 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  22.76 
 
 
525 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  27.12 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  24.81 
 
 
661 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  26 
 
 
342 aa  50.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>