20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2604 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1169    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  30.81 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  24.6 
 
 		 632 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  35.9 
 
 		 661 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  26.16 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  24.35 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  26.63 
 
 		 623 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  23.64 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  21.48 
 
 		 613 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  23.6 
 
 		 618 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  24.7 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  35.14 
 
 		 433 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  23.71 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  28.88 
 
 		 432 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  24.06 
 
 		 638 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  28.88 
 
 		 432 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  24.06 
 
 		 638 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  24.06 
 
 		 638 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  24.06 
 
 		 638 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  28.67 
 
 		 438 aa  47.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>