18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2605 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 661 aa  1342    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  26.03 
 
 		 632 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  24.65 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  35.9 
 
 		 609 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  24.77 
 
 		 609 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.07 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  21.45 
 
 		 525 aa  67  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  24.85 
 
 		 623 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  44.23 
 
 		 618 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  29.89 
 
 		 617 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  26.19 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  23.69 
 
 		 636 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  26.19 
 
 		 313 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  26.87 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  26.19 
 
 		 313 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  23.68 
 
 		 410 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  22.93 
 
 		 612 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>