17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3229 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1233    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  46.57 
 
 
623 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  45.33 
 
 
636 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  67.8 
 
 
355 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  36.36 
 
 
701 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  26.8 
 
 
618 aa  180  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  26.52 
 
 
617 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  24.79 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  26.62 
 
 
609 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  71.74 
 
 
689 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.22 
 
 
613 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  21.61 
 
 
525 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  23.08 
 
 
632 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  21.28 
 
 
610 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  23.72 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  23.98 
 
 
609 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0727  hypothetical protein  24.8 
 
 
271 aa  52.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>