18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1190 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1253    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  28.87 
 
 		 617 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  29.43 
 
 		 609 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  27.29 
 
 		 618 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  25.08 
 
 		 613 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  25.16 
 
 		 610 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  24.79 
 
 		 610 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  26.59 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  26.51 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  25.44 
 
 		 632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  24.23 
 
 		 525 aa  114  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  25.74 
 
 		 400 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  26.22 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0460  hypothetical protein  23.79 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  21.94 
 
 		 701 aa  63.9  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  40 
 
 		 689 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0727  hypothetical protein  24.89 
 
 		 271 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  22.93 
 
 		 661 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>