15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1414 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  100 
 
 
701 aa  1386    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  35.81 
 
 
610 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  35.76 
 
 
623 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  35.09 
 
 
636 aa  300  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  34.89 
 
 
355 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  25.89 
 
 
617 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  26.45 
 
 
618 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  25.91 
 
 
609 aa  105  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  26.19 
 
 
610 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  22.38 
 
 
612 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  22.87 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  21.68 
 
 
613 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  23.92 
 
 
632 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  31.97 
 
 
689 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  31.34 
 
 
400 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>