16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0731 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1081    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0727  hypothetical protein  99.46 
 
 
271 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.08 
 
 
613 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  24.23 
 
 
612 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  24.4 
 
 
618 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  24.68 
 
 
617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  22.04 
 
 
609 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  21.28 
 
 
610 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  21.61 
 
 
610 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  21.9 
 
 
632 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  22.76 
 
 
623 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  21.85 
 
 
636 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0460  hypothetical protein  23.44 
 
 
493 aa  67  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  21.45 
 
 
661 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  22.87 
 
 
701 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  21.28 
 
 
400 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>