19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1517 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1253    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  26.19 
 
 
617 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  23.78 
 
 
609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  25.08 
 
 
612 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  23.76 
 
 
618 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  26 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  25.04 
 
 
632 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  25.67 
 
 
623 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  23.08 
 
 
525 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  23.22 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  23.01 
 
 
610 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  25.32 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  23.07 
 
 
661 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0460  hypothetical protein  22.25 
 
 
493 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  21.68 
 
 
701 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  23.57 
 
 
400 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  24.1 
 
 
609 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  23.9 
 
 
597 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0727  hypothetical protein  22.95 
 
 
271 aa  49.3  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>