19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3528 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  93.08 
 
 
623 aa  1124    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1270    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  45.33 
 
 
610 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  35.09 
 
 
701 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  48.53 
 
 
355 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  30.46 
 
 
617 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  30.4 
 
 
618 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  27.39 
 
 
609 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  26.59 
 
 
612 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  26 
 
 
613 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  25.45 
 
 
632 aa  123  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  24.8 
 
 
610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  65.48 
 
 
689 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  29.7 
 
 
400 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  21.85 
 
 
525 aa  80.9  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  25.38 
 
 
609 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  23.64 
 
 
661 aa  62  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  25.63 
 
 
342 aa  47  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0727  hypothetical protein  25.79 
 
 
271 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>