18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0028 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1280    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  30.25 
 
 		 618 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  29.69 
 
 		 617 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  25.73 
 
 		 609 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  25.44 
 
 		 612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  25.04 
 
 		 613 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  26.03 
 
 		 661 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  25.8 
 
 		 623 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  25.45 
 
 		 636 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  26.09 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  25.08 
 
 		 609 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  26.46 
 
 		 400 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  21.9 
 
 		 525 aa  89  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  23.08 
 
 		 610 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  22.42 
 
 		 610 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  23.55 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  23.92 
 
 		 701 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  20.15 
 
 		 628 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>