21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2090 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1251    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2536  hypothetical protein  48.14 
 
 		 617 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4754  hypothetical protein  31.3 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3194  hypothetical protein  31.03 
 
 		 623 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1190  hypothetical protein  27.29 
 
 		 612 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204201  normal  0.1151 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3528  hypothetical protein  30.4 
 
 		 636 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  30.25 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3229  hypothetical protein  26.55 
 
 		 610 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3201  hypothetical protein  27.04 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1517  hypothetical protein  23.76 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675511  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2500  hypothetical protein  29.85 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1414  hypothetical protein  26.45 
 
 		 701 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3183  hypothetical protein  28.48 
 
 		 355 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0731  hypothetical protein  24.4 
 
 		 525 aa  117  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0530623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0460  hypothetical protein  27.41 
 
 		 493 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  26 
 
 		 597 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  34.15 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0940  hypothetical protein  33.81 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2166  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  24.12 
 
 		 609 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  32.98 
 
 		 661 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0727  hypothetical protein  20.44 
 
 		 271 aa  48.5  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>