24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4722 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1404    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  30.22 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  30.22 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  30.22 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  30.22 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  27.32 
 
 		 363 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  26.92 
 
 		 605 aa  55.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  29.22 
 
 		 488 aa  55.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  39.39 
 
 		 307 aa  54.3  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  29.36 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1629  hypothetical protein  24.73 
 
 		 506 aa  51.6  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  33.82 
 
 		 410 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  43.08 
 
 		 322 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  41.86 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  27.45 
 
 		 628 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  25.14 
 
 		 342 aa  48.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  28.41 
 
 		 425 aa  47.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  27.54 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3363  hypothetical protein  22.91 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  24.05 
 
 		 378 aa  45.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  24.05 
 
 		 378 aa  45.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06211  hypothetical protein  25.82 
 
 		 394 aa  43.9  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>