55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3049 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  826    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  31.44 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  31.44 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  29.1 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  28.99 
 
 		 433 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  28.19 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  36.89 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  36.89 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  35.64 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  34.67 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  34.17 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  36.3 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  36.3 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  27.8 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  27.8 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  29.83 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  28.07 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  28.07 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  32.82 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  33.05 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  27.37 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  27.37 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  31.43 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  29.1 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  30.63 
 
 		 849 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  30.63 
 
 		 849 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  36.36 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  24.54 
 
 		 183 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  40.54 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1175  transposition protein TniQ  30.54 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  33.75 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  37.84 
 
 		 605 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  33.68 
 
 		 433 aa  49.7  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3577  TniQ family protein  24.86 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0706835  hitchhiker  0.00685617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2233  hypothetical protein  33.75 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100569  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3008  hypothetical protein  28.14 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754024 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4043  transposon related protein TniQ (Tn6048)  28.14 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705627  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4974  transposon related protein TniQ (Tn6048)  28.14 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39202  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  25.95 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  40.26 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  36.62 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  39.62 
 
 		 664 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  45 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1705  hypothetical protein  32.47 
 
 		 193 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  35.62 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  35.62 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  30.67 
 
 		 269 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  35.62 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>