36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3855 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  88.78 
 
 		 410 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  851    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06211  hypothetical protein  23.81 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  21.6 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  32.39 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  32.39 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  23.08 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  23.08 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 628 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  28.16 
 
 		 183 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  34.52 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  26.35 
 
 		 605 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  32.91 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  32.91 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  33.75 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  33.82 
 
 		 694 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  34.78 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  38.3 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  38.3 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  36.05 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  38.3 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  38.3 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  33.85 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  32.05 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  24.8 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  31.52 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  32.94 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2233  hypothetical protein  41.86 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100569  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  34.92 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3661  hypothetical protein  30.19 
 
 		 826 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  36.36 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  34.78 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  32.94 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  34.88 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  34.88 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>