40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0542 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  923    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  31.78 
 
 		 495 aa  210  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  27.08 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  25.19 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  25.19 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  25.71 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  26.1 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  20 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  23.76 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  23.58 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  32.14 
 
 		 366 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  22.71 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  22.81 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  29.71 
 
 		 568 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  30.34 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  27.78 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  34.78 
 
 		 342 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  27.78 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  48.78 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  25.58 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  35.09 
 
 		 628 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  26.29 
 
 		 268 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  34.07 
 
 		 261 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  34.07 
 
 		 261 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  29.87 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  29.87 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  38.03 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  38.03 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  38.03 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  21.9 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  45 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  23.53 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  32.61 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  31.25 
 
 		 433 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  42.5 
 
 		 331 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  42.5 
 
 		 342 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  22.51 
 
 		 378 aa  43.9  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  22.51 
 
 		 378 aa  43.9  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>