35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0189 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  29.3 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  25.19 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  25.19 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  39.06 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  32.03 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  33.59 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  34.15 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  33.05 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  39.19 
 
 		 433 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  35.77 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  26.96 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  39.39 
 
 		 694 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  28.32 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  46.67 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  46.67 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  35.21 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  35.21 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  35.21 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  35.21 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  25.6 
 
 		 433 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  32.32 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  26.02 
 
 		 605 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  36.67 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  32.32 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  32.32 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  21.99 
 
 		 568 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  38.78 
 
 		 504 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2188  hypothetical protein  31.03 
 
 		 173 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  27.38 
 
 		 628 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  41.46 
 
 		 183 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>