45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4508 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  33.46 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  29.83 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  28.12 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  29.05 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  29.05 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  28.21 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  29.84 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  33.13 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  33.13 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  26.32 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  21.67 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  21.67 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  38.64 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  26.46 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  26.46 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  30.67 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  30.73 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  27.01 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  27.01 
 
 		 472 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  28.32 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  26.35 
 
 		 183 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  29.08 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4581  hypothetical protein  45.65 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  27.54 
 
 		 694 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  25.14 
 
 		 432 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  25.14 
 
 		 432 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  27.13 
 
 		 569 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  34.78 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  27.01 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  27.01 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  25.4 
 
 		 638 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  25.4 
 
 		 638 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  25.4 
 
 		 638 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  32.65 
 
 		 425 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  28.73 
 
 		 504 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  25.4 
 
 		 638 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  28.29 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  27.7 
 
 		 568 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  28.29 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2995  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>