45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0695 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  779    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  779    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  31.44 
 
 
397 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  28.46 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  24.29 
 
 
366 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  27.66 
 
 
342 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  28.81 
 
 
356 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  30.98 
 
 
357 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  26.98 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  30.43 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  28.35 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  28.35 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  28.69 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  28.69 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  24.24 
 
 
472 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  24.24 
 
 
472 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  24.24 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  24.24 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  21.67 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  34.95 
 
 
410 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  24.72 
 
 
261 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  24.72 
 
 
261 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  24.86 
 
 
268 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  36.23 
 
 
638 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  36.23 
 
 
638 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  36.23 
 
 
638 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  36.23 
 
 
638 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  38.24 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  22.4 
 
 
568 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  46.67 
 
 
307 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  42.55 
 
 
438 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  27.03 
 
 
329 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  26.01 
 
 
368 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  24.24 
 
 
433 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  32.35 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  32.35 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  23.95 
 
 
849 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  23.95 
 
 
849 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  21.67 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  24.05 
 
 
694 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  32.08 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  22.51 
 
 
455 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  22.15 
 
 
250 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  22.15 
 
 
250 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>