24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0030 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1292    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  27.05 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  22.67 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  22.67 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  22.67 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  22.67 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  32.22 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  27.68 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  25.38 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  23.51 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  23.51 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  33.73 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  24 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  22.38 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  28.57 
 
 		 410 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 433 aa  54.3  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  23.47 
 
 		 342 aa  53.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  27.66 
 
 		 183 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  27.72 
 
 		 366 aa  50.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3363  hypothetical protein  25.78 
 
 		 329 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  27.45 
 
 		 694 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  35.09 
 
 		 455 aa  47.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0028  hypothetical protein  20.15 
 
 		 632 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0018  hypothetical protein  28.3 
 
 		 567 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>