39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4321 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  982    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  29.23 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  22.77 
 
 		 625 aa  93.6  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  26.8 
 
 		 582 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  25 
 
 		 628 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  21.02 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  25.21 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  24.53 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  26.51 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  26.16 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  25.29 
 
 		 616 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  26.43 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  30.91 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  26.91 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  24.17 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  24.58 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  23.58 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  25.14 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  22.47 
 
 		 609 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  27.01 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  22.47 
 
 		 609 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  23.74 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  24.28 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  26.25 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  20.4 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  25.42 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  31.45 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  24.07 
 
 		 617 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  28.22 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  25.65 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  24.87 
 
 		 571 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  30.38 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  50 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  32.63 
 
 		 585 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  25.57 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  25.75 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  24.55 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  21.99 
 
 		 514 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>