19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0254 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1222    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  27.49 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  27.81 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  44.07 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  37.29 
 
 		 636 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  29.79 
 
 		 561 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  32.08 
 
 		 515 aa  50.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  26.17 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  43.59 
 
 		 625 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  50 
 
 		 569 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5191  hypothetical protein  38.3 
 
 		 366 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  40 
 
 		 591 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  29.89 
 
 		 579 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  32.63 
 
 		 477 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  41.03 
 
 		 500 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  31.88 
 
 		 393 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  23.36 
 
 		 295 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  45.71 
 
 		 628 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>