13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5408 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5426  hypothetical protein  36.15 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  40.62 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  46.94 
 
 		 563 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  31.97 
 
 		 582 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  38.46 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  32.48 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  30.53 
 
 		 625 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  26.75 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  31.88 
 
 		 585 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5191  hypothetical protein  27.66 
 
 		 366 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  39.58 
 
 		 569 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  27.12 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>