41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5566 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  100 
 
 		 563 aa  1169    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  45.54 
 
 		 561 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  33.33 
 
 		 563 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  29.9 
 
 		 636 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  27.54 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  23.35 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  28.34 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  33.12 
 
 		 295 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  26.27 
 
 		 630 aa  92.8  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  32.48 
 
 		 280 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  29.18 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  23.69 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  22.37 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  29.09 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  33.09 
 
 		 597 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  26.06 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  24.58 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  29.56 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  29.56 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  29.56 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  31.25 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  24.77 
 
 		 591 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  19.56 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  21.67 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  25.42 
 
 		 569 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  20.74 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  29.56 
 
 		 505 aa  61.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  27.81 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  28.3 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  46.94 
 
 		 393 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  27.27 
 
 		 617 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5191  hypothetical protein  46.94 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  27.27 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  26.35 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  25.31 
 
 		 435 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  21.9 
 
 		 301 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  28.19 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  28.8 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  28.14 
 
 		 571 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>