41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3950 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 
280 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  83.39 
 
 
295 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  37.54 
 
 
316 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  34.53 
 
 
628 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  42.78 
 
 
636 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  37.89 
 
 
533 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  36.65 
 
 
625 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  40 
 
 
582 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  34.95 
 
 
609 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  34.95 
 
 
609 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  35.36 
 
 
616 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  34.41 
 
 
609 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  26.64 
 
 
610 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  34.59 
 
 
569 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  32.26 
 
 
514 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  33.33 
 
 
489 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  32.48 
 
 
563 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  31.61 
 
 
561 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  33.12 
 
 
630 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  30.43 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  25.96 
 
 
591 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  24.71 
 
 
500 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  26.58 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  35.04 
 
 
597 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  27.87 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  28.57 
 
 
617 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  28.22 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  27.74 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  27.17 
 
 
569 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  25.57 
 
 
571 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  26.99 
 
 
515 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  28.95 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.9 
 
 
435 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  27.66 
 
 
579 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  31.18 
 
 
477 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  25.45 
 
 
361 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  28.57 
 
 
535 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  20.75 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  42.5 
 
 
300 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  26.32 
 
 
495 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  25.71 
 
 
523 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>