44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3495 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 
636 aa  1329    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  49.84 
 
 
628 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  38.82 
 
 
625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  39.9 
 
 
582 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  35.02 
 
 
616 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  33.81 
 
 
630 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  34.58 
 
 
597 aa  337  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  34.44 
 
 
609 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  34.44 
 
 
609 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  33.49 
 
 
609 aa  317  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  31.48 
 
 
610 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  37.24 
 
 
533 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  39.87 
 
 
316 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  25.88 
 
 
579 aa  193  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  32.58 
 
 
505 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  44.02 
 
 
295 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  32.2 
 
 
514 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  29.67 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  42.78 
 
 
280 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  24.26 
 
 
617 aa  143  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  30.07 
 
 
503 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  30.84 
 
 
489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  25.14 
 
 
532 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  28.66 
 
 
569 aa  124  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  29.9 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  27.48 
 
 
515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  27.39 
 
 
591 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  26.52 
 
 
338 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  27.64 
 
 
561 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.2 
 
 
435 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.23 
 
 
571 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  22.05 
 
 
535 aa  94.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  25 
 
 
563 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  20.6 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  34.13 
 
 
301 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  24.05 
 
 
523 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  25.71 
 
 
462 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0253  hypothetical protein  28.14 
 
 
470 aa  57  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  26.06 
 
 
569 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  37.29 
 
 
585 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  27.61 
 
 
361 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  25.81 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  24.53 
 
 
300 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5191  hypothetical protein  30.53 
 
 
366 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>