36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6968 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  40.58 
 
 		 617 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  26.52 
 
 		 636 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  26.89 
 
 		 533 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  25.08 
 
 		 582 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  25 
 
 		 628 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  28.52 
 
 		 609 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  28.52 
 
 		 609 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  26.64 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  30.91 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  22.11 
 
 		 625 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  25.08 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  26.6 
 
 		 609 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  23.93 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  24.78 
 
 		 571 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  25.17 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  27.81 
 
 		 514 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  21.43 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  26.21 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  28.12 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  32.16 
 
 		 591 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  28.95 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  27.61 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.79 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  23.13 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  22.51 
 
 		 597 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  22.97 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  25.11 
 
 		 561 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  26.67 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  31.11 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  27.27 
 
 		 563 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  34 
 
 		 563 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  27.67 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  54.55 
 
 		 495 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  21.71 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  27.45 
 
 		 532 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>