11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1036 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  913    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  22.2 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  25.25 
 
 		 329 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  21.59 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  21.43 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  21.43 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  22.59 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  25.77 
 
 		 299 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  23.53 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>