21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2451 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
463 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
463 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  34.8 
 
 
329 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  28.97 
 
 
471 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  26.32 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  26.91 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  28 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  28 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  29.67 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  26.87 
 
 
434 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  26.9 
 
 
495 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  27.14 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  23.76 
 
 
455 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  23.21 
 
 
480 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  25.77 
 
 
449 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  25.34 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  21.98 
 
 
460 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  25.34 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  25.34 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>