21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1657 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  36.05 
 
 
471 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
463 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
463 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  34.8 
 
 
299 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  33.78 
 
 
425 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  27.92 
 
 
432 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  27.92 
 
 
432 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  30.34 
 
 
438 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  31.07 
 
 
476 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  27 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  28.93 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  29.94 
 
 
495 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  26.67 
 
 
460 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  25.94 
 
 
405 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  30.77 
 
 
199 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.230149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  25.25 
 
 
449 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  24.18 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  22.81 
 
 
455 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  27.03 
 
 
378 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  27.03 
 
 
378 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>