20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2450 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
463 aa  951    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
463 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  28.96 
 
 
471 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  32.94 
 
 
329 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  34.09 
 
 
299 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  27.54 
 
 
432 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  27.54 
 
 
432 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  25.89 
 
 
449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  27.79 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  27.59 
 
 
433 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  24.94 
 
 
425 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  25.82 
 
 
476 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  23.76 
 
 
480 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  22.56 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  24.07 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  25.4 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5664  hypothetical protein  36.73 
 
 
98 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  24.15 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  24.6 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  34.88 
 
 
199 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.230149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>