17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4715 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4715  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  361  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  27.04 
 
 
849 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  27.04 
 
 
849 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  28.92 
 
 
269 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  25.48 
 
 
568 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  29.14 
 
 
250 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  29.14 
 
 
250 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  32.2 
 
 
433 aa  45.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0884  hypothetical protein  25.93 
 
 
556 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  25.14 
 
 
357 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  34.92 
 
 
356 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  36.51 
 
 
353 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  36.51 
 
 
353 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  40.43 
 
 
331 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  25.14 
 
 
357 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  40.43 
 
 
342 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>