14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0375 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1009    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  24 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  29.22 
 
 		 694 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  22.27 
 
 		 605 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  36.78 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  26.81 
 
 		 363 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  47.22 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  47.22 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  47.22 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  47.22 
 
 		 638 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  31.82 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1629  hypothetical protein  30.61 
 
 		 506 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0365  hypothetical protein  24.28 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.944034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  50 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>