16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0883 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  761    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  27.25 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  27.25 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  25.35 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  25.84 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  26.24 
 
 
337 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  26.24 
 
 
337 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.42 
 
 
300 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  26.38 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  28.78 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.37 
 
 
304 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  23.62 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  23.62 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  23.62 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  23.62 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  25.41 
 
 
440 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>