25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0497 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  767    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  45.1 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  45.1 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  34.86 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  26.52 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  25.53 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  25.53 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3574  hypothetical protein  29.82 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  25.35 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  26.15 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  23.73 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.78 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  24.17 
 
 		 312 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  24 
 
 		 500 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  23.39 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  26.34 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  23.66 
 
 		 551 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  25.56 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  26.92 
 
 		 536 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  25.56 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  25.56 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  25.56 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  23.55 
 
 		 289 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  23.55 
 
 		 289 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>