38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3554 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  100 
 
 		 335 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  100 
 
 		 335 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  85.63 
 
 		 335 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  72.67 
 
 		 331 aa  511  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  73.35 
 
 		 331 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  72.54 
 
 		 331 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.37 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  64.07 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  57.98 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  57.61 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  52.08 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.66 
 
 		 329 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.7 
 
 		 340 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.46 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  47.92 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  46.13 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  48.51 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  35.89 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  24.22 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.25 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.45 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.8 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.53 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  25.53 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.46 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  26.24 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.76 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.76 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  22.19 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  25.15 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.24 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.9 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  22.89 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.92 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  23.47 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.71 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.59 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  21.72 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>