44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3556 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 501 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  71.06 
 
 		 501 aa  764    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  93.41 
 
 		 501 aa  990    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  70.18 
 
 		 499 aa  731    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 501 aa  1047    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  71.2 
 
 		 500 aa  769    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  56.19 
 
 		 494 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  55.14 
 
 		 531 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.38 
 
 		 497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.33 
 
 		 263 aa  219  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  37.12 
 
 		 310 aa  192  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  39.22 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.88 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.01 
 
 		 515 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  26.86 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.64 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.6 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  26.18 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  27.21 
 
 		 556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.9 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  26.01 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  24.54 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 519 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  27.15 
 
 		 560 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  27.15 
 
 		 555 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.05 
 
 		 516 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  28.29 
 
 		 552 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  26.92 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  26.33 
 
 		 556 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.94 
 
 		 517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.84 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  27.25 
 
 		 555 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  26.29 
 
 		 552 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.85 
 
 		 514 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.11 
 
 		 528 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.44 
 
 		 545 aa  116  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2539  toluene monooxygenase alpha subunit  58.7 
 
 		 130 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  24.3 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  27.93 
 
 		 549 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.15 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.15 
 
 		 514 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  25.67 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  24.16 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  24.35 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>