More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3478 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 		 323 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 		 323 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  87.93 
 
 		 323 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  64.4 
 
 		 323 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  61.3 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  58.88 
 
 		 326 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  50 
 
 		 340 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  49.69 
 
 		 333 aa  322  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.19 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  46.88 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  46.25 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.77 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  43.38 
 
 		 325 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1910  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.88 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  47.52 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  44.55 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.65 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7673  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.62 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.690652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.24 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.47 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.59 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5093  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.58 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  hitchhiker  0.0090718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.77 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.94 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.37 
 
 		 367 aa  275  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  40.43 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5376  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.27 
 
 		 347 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.904617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.56 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.46 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1843  Mg2+/Co2+ transporter  43.65 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3867  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  43.65 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.15 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.15 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.15 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.15 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.34 
 
 		 323 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  42.15 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.98 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1874  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.49 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.69 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.46 
 
 		 404 aa  264  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.69 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.69 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.69 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  41.49 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1742  Mg2+ transporter protein, CorA-like  42.11 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.07 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.03 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.04 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.38 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.69 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  39.2 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.54 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  40.71 
 
 		 384 aa  245  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  40.67 
 
 		 372 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.89 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.35 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.08 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.27 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.82 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.97 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.12 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.48 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.06 
 
 		 365 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  38.05 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  36.06 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.58 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.33 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.33 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.33 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.69 
 
 		 358 aa  225  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.47 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.76 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  34.38 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.34 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.38 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.16 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  38.46 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.76 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.54 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.99 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.65 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.13 
 
 		 374 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.75 
 
 		 417 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.58 
 
 		 382 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4998  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.99 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442957  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.15 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.75 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.27 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.69 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.5 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  34.64 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.01 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.27 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.77 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.26 
 
 		 391 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.08 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.07 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.93 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02010  magnesium Mg(2+) and cobalt Co(2+) transport protein CorA  31.96 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>