174 genes were found for organism Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmet_6183  CDS  NC_007972  32442  34127  +  1686  putative mercuric reductase  YP_581992  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6184  CDS  NC_007972  34145  34510  +  366  transcriptional regulator MerD  YP_581993  hitchhiker  0.00899328  hitchhiker  0.000000958868  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6185  CDS  NC_007972  34507  34743  +  237  putative mercury resistance protein  YP_581994  normal  0.0103458  hitchhiker  0.000000905807  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6186  CDS  NC_007972  34740  35729  +  990  diguanylate phosphodiesterase  YP_581995  normal  0.0493195  hitchhiker  0.0000013471  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6187  CDS  NC_007972  35859  36419  +  561  resolvase-like protein  YP_581996  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6188  CDS  NC_007972  36422  39391  +  2970  transposase Tn3  YP_581997  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6189  CDS  NC_007972  39448  39882  +  435  hypothetical protein  YP_581998  normal  0.102865  hitchhiker  0.0000588211  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6190  CDS  NC_007972  39922  40980  +  1059  hypothetical protein  YP_581999  normal  0.0691552  hitchhiker  0.000300177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6191  CDS  NC_007972  41064  41486  +  423  histone-like DNA-binding protein  YP_582000  normal  0.0442446  hitchhiker  0.00020029  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6192  CDS  NC_007972  41851  42804  +  954  hypothetical protein  YP_582001  normal  0.0649171  hitchhiker  0.000226919  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6193  CDS  NC_007972  42801  44288  +  1488  phage integrase-like SAM-like  YP_582002  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6194  CDS  NC_007972  44476  45522  -  1047  hypothetical protein  YP_582003  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6195  CDS  NC_007972  45539  46465  -  927  hypothetical protein  YP_582004  normal  1  hitchhiker  0.000214863  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6196  CDS  NC_007972  46523  47764  -  1242  major facilitator transporter  YP_582005  normal  1  hitchhiker  0.000226919  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6197  CDS  NC_007972  47787  48095  -  309  hypothetical protein  YP_582006  normal  1  hitchhiker  0.00181565  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6198  CDS  NC_007972  48115  48474  -  360  hypothetical protein  YP_582007  normal  1  hitchhiker  0.00203887  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6199  CDS  NC_007972  48533  48955  -  423  hypothetical protein  YP_582008  normal  1  hitchhiker  0.00558934  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6200  CDS  NC_007972  48952  49293  -  342  rhodanese-like protein  YP_582009  normal  1  hitchhiker  0.00527926  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6201  CDS  NC_007972  49311  49904  -  594  manganese and iron superoxide dismutase  YP_582010  normal  1  hitchhiker  0.00555386  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6202  CDS  NC_007972  49924  51129  -  1206  chromate transporter  YP_582011  normal  1  normal  0.0320947  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6203  CDS  NC_007972  51172  52146  -  975  putative chromate resistance signal peptide protein  YP_582012  normal  0.941608  normal  0.0314221  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6204  CDS  NC_007972  52301  52795  +  495  hypothetical protein  YP_582013  normal  0.0594792  normal  0.0269002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6205  CDS  NC_007972  53310  53597  +  288  hypothetical protein  YP_582014  normal  0.178067  normal  0.0520704  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6206  CDS  NC_007972  53594  54040  +  447  hypothetical protein  YP_582015  normal  0.252012  normal  0.0584533  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6207  CDS  NC_007972  54037  54612  +  576  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_582016  normal  0.774126  normal  0.0584533  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6208  CDS  NC_007972  54685  55941  +  1257  outer membrane efflux protein  YP_582017  normal  1  normal  0.0682247  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6209  CDS  NC_007972  55938  57125  +  1188  membrane fusion protein cluster 2  YP_582018  normal  0.401631  normal  0.0698846  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6210  CDS  NC_007972  57122  60352  +  3231  heavy metal efflux pump CzcA  YP_582019  normal  0.339725  normal  0.173806  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6211  CDS  NC_007972  60398  61453  +  1056  hypothetical protein  YP_582020  normal  1  normal  0.286118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6212  CDS  NC_007972  61544  64483  -  2940  transposase Tn3  YP_582021  normal  1  normal  0.809393  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6213  CDS  NC_007972  64695  65126  -  432  hypothetical protein  YP_582022  normal  1  normal  0.521083  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6214  CDS  NC_007972  65205  65447  -  243  hypothetical protein  YP_582023  normal  1  normal  0.497953  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6215    NC_007972  65517  65864  -  348      normal  1  normal  0.507916  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6216  CDS  NC_007972  66025  67515  -  1491  hypothetical protein  YP_582025  normal  1  normal  0.621118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6217  CDS  NC_007972  67902  68186  -  285  hypothetical protein  YP_582026  normal  1  normal  0.509951  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6218  CDS  NC_007972  68478  70751  -  2274  putative DNA repair ATPase  YP_582027  normal  1  normal  0.657002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6219  CDS  NC_007972  70790  71305  -  516  hypothetical protein  YP_582028  normal  1  normal  0.504697  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6220  CDS  NC_007972  71484  72932  -  1449  DNA repair exonuclease-like protein  YP_582029  normal  1  normal  0.592286  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6221  CDS  NC_007972  73029  74282  -  1254  hypothetical protein  YP_582030  normal  1  normal  0.551734  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6222  CDS  NC_007972  74294  74803  -  510  hypothetical protein  YP_582031  normal  1  normal  0.677666  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6223  CDS  NC_007972  75252  75818  +  567  hypothetical protein  YP_582032  normal  0.0952384  normal  0.445112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6224  CDS  NC_007972  75805  76443  +  639  hypothetical protein  YP_582033  normal  0.103855  normal  0.451595  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6225  CDS  NC_007972  76455  76874  +  420  hypothetical protein  YP_582034  normal  0.0551295  normal  0.629644  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6226  CDS  NC_007972  76975  77496  -  522  hypothetical protein  YP_582035  normal  0.0594318  normal  0.66708  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6227  CDS  NC_007972  77614  78588  -  975  hypothetical protein  YP_582036  normal  0.0256712  normal  0.704554  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6228  CDS  NC_007972  79038  80588  -  1551  hypothetical protein  YP_582037  normal  0.0896395  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6229  CDS  NC_007972  80654  81007  -  354  hypothetical protein  YP_582038  normal  0.0231417  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6230  CDS  NC_007972  81065  81457  -  393  hypothetical protein  YP_582039  hitchhiker  0.00591168  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6231  CDS  NC_007972  81701  82171  -  471  hypothetical protein  YP_582040  normal  0.0190037  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6232  CDS  NC_007972  82184  82708  -  525  hypothetical protein  YP_582041  normal  0.0488414  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6233  CDS  NC_007972  82790  83263  -  474  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  YP_582042  normal  0.0997303  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6234  CDS  NC_007972  83745  84449  -  705  hypothetical protein  YP_582043  normal  0.248648  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6235  CDS  NC_007972  84644  85447  -  804  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  YP_582044  normal  0.918479  normal  0.783073  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6236  CDS  NC_007972  85444  86085  -  642  hypothetical protein  YP_582045  normal  1  normal  0.762769  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6237  CDS  NC_007972  86088  86807  -  720  hypothetical protein  YP_582046  normal  1  normal  0.807931  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6238  CDS  NC_007972  86817  87956  -  1140  hypothetical protein  YP_582047  normal  0.939997  normal  0.417124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6239  CDS  NC_007972  88047  88271  -  225  hypothetical protein  YP_582048  normal  0.844528  normal  0.528701  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6240  CDS  NC_007972  88282  88800  -  519  hypothetical protein  YP_582049  normal  1  normal  0.559463  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6241  CDS  NC_007972  88826  90550  -  1725  ParB family protein  YP_582050  normal  1  normal  0.670626  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6242  CDS  NC_007972  91159  91578  +  420  hypothetical protein  YP_582051  normal  0.951589  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6243  CDS  NC_007972  91803  92696  -  894  hypothetical protein  YP_582052  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6244  CDS  NC_007972  92838  93317  -  480  hypothetical protein  YP_582053  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6245  CDS  NC_007972  93421  93657  -  237  hypothetical protein  YP_582054  normal  0.720836  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6246  CDS  NC_007972  93787  94470  -  684  hypothetical protein  YP_582055  normal  0.182009  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6247  CDS  NC_007972  94469  94918  +  450  hypothetical protein  YP_582056  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6248  CDS  NC_007972  94915  96375  +  1461  putative DNA helicase  YP_582057  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6249  CDS  NC_007972  96387  97613  +  1227  hypothetical protein  YP_582058  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6250  CDS  NC_007972  97600  97968  +  369  hypothetical protein  YP_582059  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6251  CDS  NC_007972  98032  98349  +  318  hypothetical protein  YP_582060  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6252  CDS  NC_007972  98748  99893  +  1146  phage integrase-like SAM-like  YP_582061  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6253  CDS  NC_007972  99868  101526  +  1659  phage integrase  YP_582062  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6254  CDS  NC_007972  101586  103436  +  1851  phage integrase  YP_582063  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6255  CDS  NC_007972  103433  103933  +  501  hypothetical protein  YP_582064  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6256  CDS  NC_007972  104235  105680  -  1446  hypothetical protein  YP_582065  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6257  CDS  NC_007972  105677  110101  -  4425  hypothetical protein  YP_582066  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6258  CDS  NC_007972  110770  112299  +  1530  YD repeat-containing protein  YP_582067  normal  0.207507  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6259  CDS  NC_007972  112304  113059  -  756  IstB-like ATP-binding protein  YP_582068  normal  0.111969  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6260  CDS  NC_007972  113067  114620  -  1554  integrase catalytic subunit  YP_582069  normal  0.441371  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6261  CDS  NC_007972  115050  116249  +  1200  YD repeat-containing protein  YP_582070  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6262  CDS  NC_007972  116588  117280  -  693  alpha/beta hydrolase  YP_582071  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6263  CDS  NC_007972  117594  120413  +  2820  YD repeat-containing protein  YP_582072  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6264  CDS  NC_007972  121057  122067  +  1011  phage Gp37Gp68  YP_582073  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6265  CDS  NC_007972  122113  122355  +  243  hypothetical protein  YP_582074  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6266  CDS  NC_007972  122352  122597  +  246  hypothetical protein  YP_582075  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6267  CDS  NC_007972  122692  123282  +  591  hypothetical protein  YP_582076  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6268  CDS  NC_007972  123312  124226  +  915  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_582077  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6269  CDS  NC_007972  124317  125111  -  795  hypothetical protein  YP_582078  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6271  CDS  NC_007972  126004  126750  +  747  hypothetical protein  YP_582080  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6272  CDS  NC_007972  127143  128279  -  1137  hypothetical protein  YP_582081  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6273  CDS  NC_007972  128893  130047  -  1155  helix-turn-helix, Fis-type  YP_582082  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6274  CDS  NC_007972  130614  130856  +  243  hypothetical protein  YP_582083  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6275  CDS  NC_007972  131176  132201  +  1026  hypothetical protein  YP_582084  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6276  CDS  NC_007972  132900  133166  -  267  hypothetical protein  YP_582085  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6277  CDS  NC_007972  133209  134276  -  1068  phage P4 alpha zinc-binding protein  YP_582086  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6278  CDS  NC_007972  134542  135114  -  573  single-stranded DNA-binding protein  YP_582087  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6279  CDS  NC_007972  135126  135908  -  783  hypothetical protein  YP_582088  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6280  CDS  NC_007972  135916  136347  -  432  hypothetical protein  YP_582089  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6281  CDS  NC_007972  136446  136754  -  309  hypothetical protein  YP_582090  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6282  CDS  NC_007972  137456  138475  -  1020  integrase catalytic subunit  YP_582091  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6283  CDS  NC_007972  138550  139728  +  1179  hypothetical protein  YP_582092  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>