11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6240 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6240  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  339  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.559463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1597  hypothetical protein  64 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5239  hypothetical protein  64 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5590  hypothetical protein  47.12 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6528  hypothetical protein  41.1 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5021  hypothetical protein  35.56 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5340  hypothetical protein  30.53 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000251545  normal  0.961926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1592  hypothetical protein  33.09 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0726764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3821  hypothetical protein  35.35 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0919526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2541  hypothetical protein  39.05 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.300525 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5054  hypothetical protein  31.58 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>