41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6235 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  73.44 
 
 		 266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  69.78 
 
 		 272 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  69.35 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  49.25 
 
 		 280 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.89 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.61 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.76 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.66 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.56 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  43.14 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.38 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.02 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.5 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.89 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.55 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.69 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.07 
 
 		 292 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  25.38 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  25.38 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  25.38 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.93 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  21.32 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0694  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.5 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54460  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 1  33.08 
 
 		 1108 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  33.33 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.8 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.17 
 
 		 469 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.8 
 
 		 260 aa  45.4  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  37.08 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 		 367 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.7 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.95 
 
 		 393 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.28 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.31 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.54 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0798  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.5 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 		 464 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  28.3 
 
 		 451 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.51 
 
 		 347 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>