More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4133 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
464 aa  929    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1950  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.78 
 
 
471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1999  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.59 
 
 
470 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.98 
 
 
458 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
469 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1399  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.51 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.97 
 
 
468 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.822327  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4015  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.68 
 
 
476 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0118  putative HesA/moeB/thiF family protein  31.28 
 
 
264 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.61 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  38 
 
 
280 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.01 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.79 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.17 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.07 
 
 
259 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.36 
 
 
282 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.57 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  33.59 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.99 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.41 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.12 
 
 
598 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  32.58 
 
 
379 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.63 
 
 
282 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.8 
 
 
243 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
270 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.75 
 
 
273 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 
256 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
268 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.59 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.28 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.14 
 
 
259 aa  64.3  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  37.14 
 
 
272 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19210  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  37.27 
 
 
413 aa  63.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0193434  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.51 
 
 
392 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.39 
 
 
604 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.19 
 
 
263 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.05 
 
 
294 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.25 
 
 
278 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 
275 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
254 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 
265 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  25.87 
 
 
340 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  27.54 
 
 
236 aa  61.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41002  predicted protein  37.39 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.93 
 
 
199 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
244 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 
348 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.85 
 
 
266 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.86 
 
 
275 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0354  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.49 
 
 
317 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30 
 
 
245 aa  60.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.28 
 
 
371 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  31.11 
 
 
235 aa  60.1  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.67 
 
 
248 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.75 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.09 
 
 
255 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0600  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.71 
 
 
214 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.2 
 
 
199 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  29.1 
 
 
250 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  30.77 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  29.91 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  38.79 
 
 
233 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3634  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.61 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.71 
 
 
216 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38170  predicted protein  35.21 
 
 
268 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0037  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.05 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  34.48 
 
 
307 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.12 
 
 
604 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.14 
 
 
266 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  50 
 
 
272 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.56 
 
 
684 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 
277 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  29.61 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81395  predicted protein  26.88 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.45 
 
 
263 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.78 
 
 
249 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6927  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.67 
 
 
362 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.64 
 
 
264 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.98 
 
 
242 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0777  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.5 
 
 
245 aa  58.2  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  32.56 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.12 
 
 
604 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  29.2 
 
 
387 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  28.97 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  30.77 
 
 
287 aa  57.4  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.57 
 
 
260 aa  57.4  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.82 
 
 
266 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 
407 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.66 
 
 
364 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.06 
 
 
254 aa  57.4  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.44 
 
 
249 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.38 
 
 
249 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  29.93 
 
 
264 aa  57  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>