More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1999 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1999  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
470 aa  961    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1950  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.97 
 
 
471 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
464 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.89 
 
 
458 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.62 
 
 
469 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1399  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.33 
 
 
465 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
468 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.822327  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4015  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.64 
 
 
476 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0118  putative HesA/moeB/thiF family protein  31.55 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
282 aa  67  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.94 
 
 
256 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  31.58 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.14 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  33.13 
 
 
280 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.26 
 
 
443 aa  65.1  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
284 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.37 
 
 
282 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  29.22 
 
 
272 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.66 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  35.35 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 
282 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2480  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.21 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.201221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.82 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.48 
 
 
281 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.04 
 
 
249 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.53 
 
 
264 aa  60.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.64 
 
 
598 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.85 
 
 
387 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.92 
 
 
291 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  28.04 
 
 
235 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.24 
 
 
604 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.24 
 
 
604 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.12 
 
 
604 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.71 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  29.2 
 
 
252 aa  57.4  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2074  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.41 
 
 
332 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316496  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.93 
 
 
237 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.85 
 
 
242 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.46 
 
 
242 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  28.89 
 
 
247 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  30.83 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.21 
 
 
273 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  34.26 
 
 
249 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.54 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.65 
 
 
267 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.52 
 
 
354 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.88 
 
 
244 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.39 
 
 
237 aa  54.7  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19210  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.77 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0193434  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  34.4 
 
 
252 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0766  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.14 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0217212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  33.8 
 
 
252 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.92 
 
 
294 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.59 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.64 
 
 
255 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.4 
 
 
375 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.82 
 
 
399 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 
242 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35 
 
 
387 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  29.41 
 
 
340 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.36 
 
 
348 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  31.36 
 
 
349 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34373  predicted protein  33.06 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  28.85 
 
 
300 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.4 
 
 
213 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.83 
 
 
364 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  30.83 
 
 
260 aa  52.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25.73 
 
 
248 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 
247 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00531734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.27 
 
 
254 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.43 
 
 
339 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  40.74 
 
 
255 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  34.96 
 
 
276 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.41 
 
 
239 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.23 
 
 
258 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.3 
 
 
255 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
338 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.46 
 
 
318 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.14 
 
 
407 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.6 
 
 
266 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.55 
 
 
254 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.69 
 
 
252 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.56 
 
 
348 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.39 
 
 
250 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1883  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.68 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4724  hypothetical protein  26.7 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0242073  normal  0.178225 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  35.11 
 
 
232 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6927  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.91 
 
 
362 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.88 
 
 
257 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0018  hypothetical protein  25.58 
 
 
347 aa  51.2  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.48 
 
 
243 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.1 
 
 
252 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.62 
 
 
339 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.09 
 
 
278 aa  50.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.69 
 
 
252 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.69 
 
 
252 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.56 
 
 
244 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.62 
 
 
339 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.43862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>