More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0252 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.22 
 
 
282 aa  338  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.52 
 
 
284 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.89 
 
 
282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.56 
 
 
281 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  55.93 
 
 
272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  52.99 
 
 
280 aa  294  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.25 
 
 
273 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1706  ThiF protein, putative  49.44 
 
 
272 aa  235  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.55 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
264 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1679  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.78 
 
 
259 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.89 
 
 
294 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.65 
 
 
285 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  39.11 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.84 
 
 
226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2093  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.62 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.269505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2153  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.18 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.779112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2459  thiF protein, putative  37.39 
 
 
284 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.14 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.92 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.04 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1953  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.42 
 
 
336 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.13 
 
 
443 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.51 
 
 
256 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2316  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.97 
 
 
279 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.48 
 
 
257 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.89 
 
 
245 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.83 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.84 
 
 
237 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 
253 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  31.94 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 
258 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.14 
 
 
239 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.28 
 
 
247 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.06 
 
 
246 aa  102  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.42 
 
 
379 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.86 
 
 
247 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.04 
 
 
241 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  28.95 
 
 
368 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  28.95 
 
 
368 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.02 
 
 
249 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.08 
 
 
243 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  31.08 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2835  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.77 
 
 
278 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.69 
 
 
223 aa  98.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.61 
 
 
386 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.87 
 
 
380 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0187  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.19 
 
 
248 aa  95.9  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.635564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.03 
 
 
244 aa  95.9  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.94 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.62 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.33 
 
 
248 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.28 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.66 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.81 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  29.69 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.02 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.13 
 
 
356 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  28.51 
 
 
381 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.92 
 
 
364 aa  92.4  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.13 
 
 
480 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3575  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.15 
 
 
338 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.87 
 
 
249 aa  92.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.05 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.82 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3275  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  28.7 
 
 
338 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.649383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.55 
 
 
236 aa  92  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.96 
 
 
364 aa  92  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.37 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3361  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  28.7 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3624  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  28.7 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  33.96 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  29.13 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3325  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  28.7 
 
 
338 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.52 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  28.81 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  29.91 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  32.21 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  28.7 
 
 
391 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.12 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  29.33 
 
 
381 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17761  molybdopterin biosynthesis protein  29.33 
 
 
381 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  29.46 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3592  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.27 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  31.46 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  26.41 
 
 
379 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  30.87 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.65 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3582  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.27 
 
 
338 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.07 
 
 
386 aa  89.4  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  29.69 
 
 
269 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.07 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1642  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  28.78 
 
 
338 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.61 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.89 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2074  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.27 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316496  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0777  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.47 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.28 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>