More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6927 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6927  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
362 aa  751    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0118  putative HesA/moeB/thiF family protein  45.59 
 
 
264 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1399  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.64 
 
 
465 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.96 
 
 
469 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4015  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.63 
 
 
476 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.19 
 
 
468 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.822327  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1950  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.81 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.67 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2024  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.76 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.21 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.93 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.35 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.83 
 
 
303 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.37 
 
 
443 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.65 
 
 
248 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.59 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.1 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.9 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.34 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.71 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 
216 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.1 
 
 
306 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0777  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.12 
 
 
245 aa  59.3  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.72 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  28.67 
 
 
272 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.87 
 
 
282 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.01 
 
 
256 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.05 
 
 
237 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.62 
 
 
244 aa  56.6  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.55 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  30.99 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  28.85 
 
 
280 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  29.01 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1999  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.45 
 
 
470 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2248  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.59 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1848  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0012  hypothetical protein  32.06 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.650059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.66 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.07 
 
 
239 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.05 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853267  normal  0.0112488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 
275 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.32 
 
 
244 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  27.81 
 
 
428 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  31.21 
 
 
266 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  30.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  29.27 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  30.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  30.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  31.25 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 
259 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0462  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.46 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.987597  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  27.69 
 
 
451 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.97 
 
 
272 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  30.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.28 
 
 
396 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.16 
 
 
403 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1858  molybdopterin biosynthesis MoeB protein, putative  27.27 
 
 
333 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.95 
 
 
236 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.05 
 
 
270 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  25.15 
 
 
367 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.61 
 
 
251 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08540  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.34 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.151924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
268 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.25 
 
 
243 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.86 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.97 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
256 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  29.58 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.1 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  29.32 
 
 
250 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1231  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.04 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  30.17 
 
 
339 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  27.44 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  27.67 
 
 
248 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  27.44 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  27.31 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0909  UBA/THIF-type NAD/FAD binding  26.94 
 
 
350 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.14 
 
 
270 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2250  hypothetical protein  30 
 
 
166 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00916174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  29.58 
 
 
252 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.81 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  31.47 
 
 
282 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  31.69 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  27.44 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  26.86 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  27.21 
 
 
233 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.54 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  27.44 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  27.44 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2074  HesA/MoeB/ThiF family protein  26.57 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  28.87 
 
 
252 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.88 
 
 
263 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.63 
 
 
259 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.67 
 
 
270 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  43.33 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.66 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0075  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.66 
 
 
202 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>