More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2985 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  100 
 
 
282 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.82 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  48.02 
 
 
250 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  47.04 
 
 
249 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  47.29 
 
 
258 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00364  adenylyltransferase  47.04 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002074  sulfur carrier protein adenylyltransferase ThiF  47.04 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.53 
 
 
251 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  47.01 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.42 
 
 
252 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 
259 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  43.82 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  44.22 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  44.62 
 
 
252 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3855  adenylyltransferase ThiF  45.8 
 
 
265 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0453  thiamine biosynthesis protein ThiF  45.8 
 
 
265 aa  215  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000699536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0345  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.8 
 
 
265 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.41 
 
 
251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.63 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.886192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.36 
 
 
253 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.04 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.43 
 
 
260 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.7 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.24 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.43 
 
 
248 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  41.6 
 
 
257 aa  208  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.44 
 
 
266 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.18 
 
 
250 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0043  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein  46.43 
 
 
257 aa  206  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.562405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.31 
 
 
254 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.62 
 
 
259 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.03 
 
 
251 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.65 
 
 
254 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2390  adenylyltransferase  45.45 
 
 
251 aa  205  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648878  normal  0.790433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.82 
 
 
251 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  46.83 
 
 
251 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  45.82 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.82 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.82 
 
 
253 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.82 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.82 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.74 
 
 
254 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  45.82 
 
 
251 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.44 
 
 
259 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.74 
 
 
254 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  40.24 
 
 
245 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.74 
 
 
251 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.25 
 
 
250 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.55 
 
 
251 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  40.39 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.39 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  38.74 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.49 
 
 
250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.23 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.04 
 
 
252 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.42 
 
 
251 aa  198  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.25 
 
 
248 aa  198  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.85 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.85 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.85 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.85 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.85 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.85 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.85 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.27 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.85 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.85 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.85 
 
 
252 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.45 
 
 
250 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.04 
 
 
246 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.26 
 
 
278 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  38.28 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.53 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  39.84 
 
 
257 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.05 
 
 
271 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  37.85 
 
 
252 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  43.08 
 
 
248 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0205  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.82 
 
 
251 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.27 
 
 
251 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.65 
 
 
249 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.43 
 
 
251 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.82 
 
 
251 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.03 
 
 
251 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  41.02 
 
 
253 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.03 
 
 
252 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.65 
 
 
255 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.05 
 
 
250 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.25 
 
 
255 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.84 
 
 
247 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.04 
 
 
244 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.13 
 
 
255 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1938  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.33 
 
 
338 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.8 
 
 
259 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.38 
 
 
256 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.25 
 
 
255 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.76 
 
 
249 aa  185  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  41.34 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>