More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2914 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
250 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  98.8 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  94 
 
 
250 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  94 
 
 
250 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  94 
 
 
250 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  94 
 
 
271 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  95.2 
 
 
250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  90.24 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  90.24 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  90.24 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  90.24 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  90.24 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  90.24 
 
 
252 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  88 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  90.24 
 
 
252 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  89.02 
 
 
274 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  86.4 
 
 
252 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  86.4 
 
 
252 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  67.89 
 
 
254 aa  347  8e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  67.07 
 
 
251 aa  338  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64 
 
 
251 aa  327  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  66.53 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.4 
 
 
250 aa  323  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  63.41 
 
 
266 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  60.57 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  62.2 
 
 
259 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  63.45 
 
 
249 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.8 
 
 
254 aa  314  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  62.8 
 
 
254 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0207  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66 
 
 
249 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430763  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0249  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  65.6 
 
 
250 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0351  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  66 
 
 
249 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0392139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  64.63 
 
 
260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  65.2 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.23 
 
 
251 aa  301  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.84 
 
 
250 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  56.91 
 
 
250 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.87 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1950  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54 
 
 
250 aa  275  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  52.23 
 
 
245 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  52.82 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.21 
 
 
248 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.21 
 
 
249 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  52.03 
 
 
259 aa  255  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  46 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.79 
 
 
253 aa  250  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.2 
 
 
252 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  52.44 
 
 
248 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.75 
 
 
261 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.72 
 
 
256 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.59 
 
 
253 aa  244  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.84 
 
 
259 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.98 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  49.6 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.37 
 
 
256 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.6 
 
 
254 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.76 
 
 
255 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.39 
 
 
251 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.58 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.58 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.8 
 
 
252 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.58 
 
 
255 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.18 
 
 
255 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2390  adenylyltransferase  49.8 
 
 
251 aa  235  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648878  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.18 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.39 
 
 
251 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  42.97 
 
 
249 aa  231  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.39 
 
 
251 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.91 
 
 
244 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.18 
 
 
272 aa  228  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  45.63 
 
 
252 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.99 
 
 
251 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.34 
 
 
270 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.37 
 
 
255 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.2 
 
 
251 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.8 
 
 
255 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.58 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  45.53 
 
 
251 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.53 
 
 
251 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.09 
 
 
287 aa  224  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.63 
 
 
252 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  43.78 
 
 
249 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.43 
 
 
270 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.78 
 
 
249 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0131  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.78 
 
 
253 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.2 
 
 
249 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.18 
 
 
280 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.24 
 
 
252 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.97 
 
 
249 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.44 
 
 
256 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0125  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.78 
 
 
253 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0188818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.6 
 
 
254 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.78 
 
 
253 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.52 
 
 
255 aa  222  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 
247 aa  222  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.37 
 
 
259 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.43 
 
 
270 aa  222  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  47.98 
 
 
346 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.22 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>