More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4440 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  100 
 
 
251 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  97.21 
 
 
251 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  96.81 
 
 
251 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  97.21 
 
 
251 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  97.21 
 
 
251 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  97.21 
 
 
251 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  97.21 
 
 
251 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  96.41 
 
 
251 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  84.06 
 
 
252 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  83.27 
 
 
252 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  83.67 
 
 
252 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  84.34 
 
 
252 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  83.27 
 
 
252 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0205  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  76.1 
 
 
251 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.79 
 
 
249 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  58.94 
 
 
249 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  63.01 
 
 
249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.35 
 
 
259 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.16 
 
 
259 aa  299  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.886192  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0453  thiamine biosynthesis protein ThiF  59.53 
 
 
265 aa  298  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000699536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0345  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  59.53 
 
 
265 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3855  adenylyltransferase ThiF  59.53 
 
 
265 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0043  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein  57.26 
 
 
257 aa  267  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.562405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  49.19 
 
 
250 aa  249  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  48.57 
 
 
245 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  48.41 
 
 
253 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.19 
 
 
259 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.61 
 
 
260 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.18 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.56 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.6 
 
 
251 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.97 
 
 
248 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.81 
 
 
254 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.41 
 
 
254 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.56 
 
 
254 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.59 
 
 
249 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.97 
 
 
259 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.94 
 
 
253 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.18 
 
 
253 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
250 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.97 
 
 
259 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.18 
 
 
251 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  46.37 
 
 
257 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.42 
 
 
282 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.75 
 
 
252 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.97 
 
 
254 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.44 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  43.9 
 
 
249 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.05 
 
 
252 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.05 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.05 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.35 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.05 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.05 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.05 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.95 
 
 
250 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.95 
 
 
250 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.55 
 
 
250 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.25 
 
 
271 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.31 
 
 
247 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.95 
 
 
250 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00364  adenylyltransferase  47.24 
 
 
257 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002074  sulfur carrier protein adenylyltransferase ThiF  47.24 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.97 
 
 
251 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  43.03 
 
 
252 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.62 
 
 
251 aa  215  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.31 
 
 
249 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  44.9 
 
 
249 aa  214  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.96 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.34 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  46.96 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.86 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.91 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.91 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.97 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.46 
 
 
250 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.97 
 
 
259 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  44.49 
 
 
252 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.58 
 
 
249 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.49 
 
 
246 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.49 
 
 
249 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.53 
 
 
251 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.15 
 
 
251 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0207  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.18 
 
 
249 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430763  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0351  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.34 
 
 
249 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0392139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.35 
 
 
249 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  43.44 
 
 
257 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.96 
 
 
256 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.32 
 
 
250 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2094  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.85 
 
 
282 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  43.03 
 
 
258 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.04 
 
 
249 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.18 
 
 
255 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.78 
 
 
256 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2590  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.62 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  43.9 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.59 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>