More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2536 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
256 aa  523  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.424886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  55.56 
 
 
256 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.61 
 
 
256 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.69 
 
 
252 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.69 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.69 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.28 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  56.25 
 
 
249 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.42 
 
 
255 aa  271  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.28 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.4 
 
 
255 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  53.41 
 
 
253 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  51.61 
 
 
252 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  51.67 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.67 
 
 
249 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.06 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1546  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.42 
 
 
251 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.6 
 
 
261 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  52.72 
 
 
249 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3001  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.63 
 
 
256 aa  260  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.271778  hitchhiker  0.00000961274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2579  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.63 
 
 
256 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2481  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.63 
 
 
256 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.59 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.1 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0125  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.72 
 
 
253 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0188818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0131  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.08 
 
 
253 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0976  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.67 
 
 
249 aa  247  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0851  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.25 
 
 
249 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.88 
 
 
253 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.72 
 
 
253 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00793  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.25 
 
 
249 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00810  hypothetical protein  51.25 
 
 
249 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2818  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.25 
 
 
249 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0884  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.25 
 
 
249 aa  245  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0897  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.25 
 
 
249 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2977  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.25 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0946  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0886  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
249 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0996  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
249 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0913  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
249 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0975  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
249 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1488  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.66 
 
 
250 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49 
 
 
254 aa  234  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0912  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.57 
 
 
242 aa  234  8e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.7 
 
 
246 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.08 
 
 
259 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.71 
 
 
274 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.34 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1320  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  52.52 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06237  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.92 
 
 
236 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.94 
 
 
252 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.94 
 
 
252 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.94 
 
 
252 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.94 
 
 
252 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.94 
 
 
252 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.12 
 
 
252 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  45.53 
 
 
252 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  45.27 
 
 
252 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  48.56 
 
 
253 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.55 
 
 
251 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.33 
 
 
248 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.86 
 
 
250 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.86 
 
 
250 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
250 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.12 
 
 
259 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
250 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.86 
 
 
271 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
250 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.08 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.25 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.72 
 
 
254 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.25 
 
 
254 aa  221  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.3 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.25 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.7 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  45.02 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.02 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  47.06 
 
 
257 aa  218  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.9 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.08 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.03 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  47.08 
 
 
248 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.95 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.49 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.77 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.79 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.57 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.13 
 
 
251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  47.37 
 
 
251 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.72 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  45.6 
 
 
250 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.5 
 
 
259 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  45.31 
 
 
257 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.49 
 
 
251 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.98 
 
 
250 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.62 
 
 
251 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.57 
 
 
249 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.62 
 
 
266 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.4 
 
 
249 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.15 
 
 
248 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>