More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0345 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3855  adenylyltransferase ThiF  100 
 
 
265 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0345  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
265 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0453  thiamine biosynthesis protein ThiF  99.25 
 
 
265 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000699536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  74.71 
 
 
249 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  72.37 
 
 
259 aa  352  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  71.6 
 
 
259 aa  350  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.886192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66.15 
 
 
249 aa  337  9e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3872  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  68.87 
 
 
249 aa  331  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4492  adenylyltransferase ThiF  59.92 
 
 
252 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  59.92 
 
 
252 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  59.14 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  58.75 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4405  adenylyltransferase ThiF  59.53 
 
 
252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  61.09 
 
 
251 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  60.7 
 
 
251 aa  292  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  61.09 
 
 
251 aa  292  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  61.09 
 
 
251 aa  292  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  61.09 
 
 
251 aa  292  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  61.09 
 
 
251 aa  292  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  61.09 
 
 
251 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4440  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  59.53 
 
 
251 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259901 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0043  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein  56.98 
 
 
257 aa  276  2e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.562405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0205  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.47 
 
 
251 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  49.81 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.91 
 
 
253 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.39 
 
 
259 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.35 
 
 
259 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.86 
 
 
249 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.96 
 
 
266 aa  234  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.51 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.8 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.08 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  47.08 
 
 
248 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  44.44 
 
 
274 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
250 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.02 
 
 
250 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.02 
 
 
250 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.42 
 
 
251 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  46.67 
 
 
258 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.19 
 
 
254 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.19 
 
 
254 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.19 
 
 
252 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.81 
 
 
254 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.08 
 
 
250 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45 
 
 
251 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.7 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.13 
 
 
252 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.46 
 
 
271 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.19 
 
 
251 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.13 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.13 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  44.19 
 
 
253 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.13 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.13 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.13 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  43.13 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.08 
 
 
250 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.08 
 
 
250 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.25 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.64 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.41 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.97 
 
 
251 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.15 
 
 
259 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  43.58 
 
 
245 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.17 
 
 
250 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.25 
 
 
252 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.64 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  43.8 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.23 
 
 
377 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.78 
 
 
251 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.61 
 
 
259 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.86 
 
 
250 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.97 
 
 
252 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.51 
 
 
260 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50 
 
 
251 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.56 
 
 
251 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  45.56 
 
 
251 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.53 
 
 
247 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03864  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.73 
 
 
244 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.19 
 
 
246 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.13 
 
 
350 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2390  adenylyltransferase  49.03 
 
 
251 aa  205  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648878  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  42.47 
 
 
257 aa  205  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  42.97 
 
 
257 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.19 
 
 
249 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.94 
 
 
303 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.08 
 
 
249 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.56 
 
 
255 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
383 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
383 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.57 
 
 
249 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.77 
 
 
255 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0351  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.02 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0392139 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.41 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.46 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.19 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.58 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  42.64 
 
 
346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  43.36 
 
 
249 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
395 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>